В последнее время, преимущественно как индикаторные протозоозы при ВИЧ-инфекции, описывающих криптоспоридиоз и изоспороз. Криптоспоридиоз - протозойная кишечная инфекция, вызываемая Cryptosporidium lezze из семьи кокцидий. Источником заражения являются молодые телята, ягнята, котята, щенки, у которых наблюдается диарея. Заболевание раньше рассматривали как редкую, бессимптомную инфекцию у работников животноводческих ферм и сельского населения. Теперь оно чаще возникает у лиц с иммунодефицитами, особенно у больных ВИЧ-инфекцию, имеет затяжной или рецидивирующий характер. При глубокой иммунодефицита криптоспоридиоз может поражать легкие, желчные пути, желчный пузырь. Основным методом диагностики является микроскопия мазков испражнений, в которых обнаруживают ооцисты криптоспоридиями. Препараты окрашивают по методу Циля-Нильсена с добавлений к карболовой фуксина диметилсульфоксида. Ооцисты имеют вид ярко-красных или якраво-оранжевых дуг. С серологических методов диагностики предпочтение отдают реакции иммунофлюоресценции. Изоспороз - протозойная кишечная инфекция, которая может возникать как у животных, так и у людей. Возбудителем болезни является Isospora belli из семьи кокцидий. По своим эпидемиологическими особенностями и патогенезом это заболевание вроде криптоспоридиоза. Лабораторная диагностика основана на микроскопии мазков-отпечатков из фекалий. Необходимо помнить, что концентрация изоспор в фекалиях значительно меньше, чем криптоспоридиями, в связи с чем необходимо использовать методы обогащения путем седиментации или флотации. После обогащения мазки окрашивают по Цилю-Нильсену.