Эпителий слизистой оболочки пищевода образуется из прехордальной пластинки, все остальные элементы - из прилегающей мезенхимы. В течение пренатального онтогенеза эпителий слизистой оболочки многократно меняется. На первых неделях развития эпителий пищевода однослойный призматический. На четвертой неделе эпителий становится двухслойным, после чего в результате интенсивной пролиферации его клеток развивается физиологическая атрезия (заращение) просвета пищевода. К концу второго месяца в результате гибели значительной части эпителиоцитов просвет пищевода становится проходным. На третьем месяце эмбриогенеза пищевод выкладывает однослойный многорядный мерцательный эпителий, который на шестом месяце замещается многослойным плоским неороговевающим. Вместе с тем даже у новорожденных детей в составе эпителиальной пластинки пищевода могут случаться островки мигающих клеток респираторного эпителия. Причины трансформации одного вида эпителия в другое пренатальном морфогенезе пищевода до сих пор окончательно не выяснены. На втором месяце эмбриогенеза в пищеводе начинают формироваться железы и образуется мышечная оболочка.
