Ядрышко - это плотная структура ядра (плотность ядрышки в 1,5 раза превышает плотность ядра), которая хорошо заметна в живом неокрашенных клеток. Форма ядрышек сферическая, размер 1-5 мкм. Ядрышко хорошо красится, особенно основными красителями. Это связано с наличием в нем большого количества РНК, концентрация которого здесь в два-восемь раз выше, чем в ядре, и в два-три раза превышает концентрацию в цитоплазме. Количество ядрышек обычно соответствует количеству хромосомных наборов. Поэтому в диплоидных клетках их бывает два в ядро.
Ядрышко - это не самостоятельная структура, а производное хромосом, содержащих так называемые ядрышковые организаторы, расположенные в зонах вторичных перетяжек. Последние представляют собой локусы хромосом с высокой концентрацией и активностью синтеза РНК в интерфазе. Ядрышко - это место образования рибосомных РНК и субъединиц рибосом. ДНК ядрышковых организаторов состоит из множественных копий генов рРНК: на каждом из них синтезируется предшественник рРНК, который в зоне ядрышка связывается с белком; так образуются субъединицы рибосом.
Субмикроскопическая строение ядрышка характеризуется наличием двух основных структур: гранул диаметром 15-20 нм и фибрилл толщиной 6-8 нм. Гранулярный компонент часто располагается в виде нити (нуклеолонеммы) толщиной 0,2 мкм. Фибриллярный компонент ядрышка - это рибонуклеопротеиновые тяжи, предшественники рибосом, а гранулы - субъединицы рибосом, которые созревают. Вокруг ядрышки находится компактная зона околоядрышкового гетерохроматина. Конденсированный хроматин также размещен между петлями нуклеолонеммы.